Умеренный, переходный от морского к континентальному: вдоль балтийского побережья – морской, вдали от моря - ближе к умеренно-континентальному. Средняя температура воздуха в январе -4-7°С, в июле +15-17°С. Осадков выпадает до 700 мм. в год, в основном в осенне-зимний период (конец лета также часто бывает дождливым). Из-за влияния морских воздушных масс погода достаточно переменчива, и зачастую может меняться по несколько раз за день, особенно весной и осенью.

Благодаря мелководью, вода в море и озерах быстро прогревается и в июле доходит до +20-24°С, пляжный сезон длится с начала июня до конца августа.

Лучшее время для посещения страны - с начала мая до середины сентября для того чтобы увидеть прекрасную природу Эстонии или во время рождественских - новогодних каникул – в это время можно попасть в самую настоящую новогоднюю сказку в Старом городе Таллинна.